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Title: Molecular Epidemiology, Clinical Molecular Diagnosis and Genetic Diversity of Cutaneous Leishmaniasis in Jericho, Palestine
Authors: amer al-jawabreh
Keywords: Molecular epidemiology
Clinical molecular diagnosis and local molecular epidemiology
Method comparison
Issue Date: 2005
Abstract: n der vorliegenden Arbeit wurde die Sensitivit?t des Nachweises von Leishmanien in Giemsa-gef?rbten Bioptaten aus Hautulzerationen mittels direkter Mikroskopie mit der Sensitivit?t der ITS1-PCR verglichen. Bei der ITS1-PCR wurde eine Sensitivit?t von 87 % mit einem positiven predictive value von 100 %, sowie eine Spezifit?t von 100 % mit einem negativen predictive value von 85 % nachgewiesen. Weiterhin wurden vier verschiedene Nachweismethoden miteinander verglichen: die in vitro Kultivierung in NNN Medium, die direkte Mikroskopie von Giemsa gef?rbten Hautbioptaten, die PCR Amplifizierung der ITS1 Region aus auf Filterpapier aufgetragenen Hautbioptaten (FP) sowie die ITS1-PCR von ungef?rbten Hautbioptaten (US). Die PCR der US erwies sich als die sensitivste Methode. Die Verbreitung von Leishmanien Arten in Jericho wurde mittels molekularer Epidemiologie untersucht. Die r?umliche (Spatial) Analyse zeigte drei statistisch relevante Cluster innerhalb der kutanen Leishmaniose (CL): ein Cluster mit L. major und zwei L. tropica Cluster. Bei der Raum-Zeit–Analyse wurden vier Cluster von Kutanen Leishmaniose, zwei L. major und drei L. tropica Cluster nachgewiesen. Insgesamt 106 St?mme, die aus verschiedenen endemischen Regionen in Zentralasien, im Nahen Osten und Afrika stammen, wurden mit 10 Mikrosatellitenmarkern untersucht. Die Auswertung erfolgte über zwei Analysemethoden: die Distanz-basierte und die Modell-basierte Methode. Anhand der L. major Genomsequenz wurden PCR-Primer zur Amplifizierung von Mikrosatellitenloci von L. major entwickelt, die auf den Chromosomen 1, 3, 5, 21 und 35 liegen. Sieben unterschiedliche L. major Populationen einschlie?lich zweier genetisch isolierter Populationen im Nahen Osten wurden mit diesen Markern nachgewiesen.
URI: http://repository.aaup.edu/jspui/handle/123456789/771
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